工藤新一（小栗旬）这晚收到挑战书，称将有他的同学在修学旅行的船上被绑架，若新一不能保护好同学，须让出“高中生名侦探”的称号。新一本对修学旅行没兴趣，这封信令他次日赶到学校与小兰（黒川智花）、园子（岩佐真悠子）及班里另外约30名同学会合。
　　众人刚登上旅行用船，新一即把目光投向代理班主任北岛慎吾（ふかわりょう）、导游西田麻衣（水川あさみ）、船长东邦夫（松重丰）及船员南田恭介（西村和彦）等人，时刻保持着警惕。但园子仍神不知鬼不觉失踪。着手调查尚无头绪，他再接绑架预告电话。

　　东京湾岸区连续发生杀人事件，被害者皆为溺死，警方的调查毫无进展。警官吉冈（役所广司饰）在事发现场找到一枚纽扣，回家后却发现自己的外衣正好掉了一粒同样的扣子。其他的蛛丝马迹也表明与自己有关，他开始怀疑自己就是凶手。为此吉冈苦恼万分，而恋人春江（小西真奈美饰）却表现得十分冷淡。重返凶案现场的吉冈，听到了诡异可怕的声音，并见到一名红衣女子（叶月里绪奈饰）。女子告诉吉冈，15年前，她曾为他所爱并被他亲手杀死。
　　吉冈独自来到精神医生高木（小田切让饰）那里求助，多年的老同事宫地（伊原刚志饰）也开始怀疑吉冈，他徘徊在友情和职责之间难以做出抉择。吉冈的生活渐被击碎，他打开了连接过去和现在的秘密……

　　为自然风光所环抱的鬼切村，正经历一场惊心动魄的变革。当地大企业社长堀部伍平在野外遭到黑熊的袭击身亡，其身为副社长的外甥大吉（千叶哲也 饰）随即扶正，并力主将对很多人都至为重要的后山卖给他人。大吉的弟弟音弥（藤原龙也 饰）虽身为专务，但调皮顽劣，无心商界，加上性格的不同，因此与大吉一向不和。包括音弥和当地民俗资料馆馆长天马恭介（石坂浩二 饰）在内的许多人都反对这一决定，但大吉刚愎自用，拒不退让。此举令音弥极度不满，因此精心策划了一起完美谋杀案，并且具有强有力的不在场证明。古畑任三郎（田村正和 饰）、今泉慎太郎（西村雅彦 饰）与西园寺这一全新组合登场，迎战音弥送上的超完美谋杀案……
　　本片为新春完结篇第一部。

　　“加贺美京子”是活跃在影视界的双胞胎姐妹花大野红叶（松岛菜菜子 饰）和大野枫（松岛菜菜子 饰）作为编剧所共用的笔名，姐姐红叶内向沉稳，善写对白，妹妹枫外向干练，精于构思，多年来姐妹俩互帮互助，合作无间，最新根据古畑任三郎（田村正和 饰）取材的剧集《鬼警部古驱三四郎》也大受好评。可是红叶疲惫之极，打算和妹妹分道扬镳，撰写自己喜欢的剧本。多年来的积怨，终于促使她向强势的妹妹举起手枪，并与之互换身份，伪装成“红叶”自杀的假想。此前借刑事剧的关系，单身的古畑似乎和枫产生些许的暧昧与好感，而今他却必须面对这一充满悲剧气息的双胞胎谋杀案……
　　本片为新春完结篇第三部。

　　人气极旺的名棒球手一郎（一郎 饰）从美国回到日本，引起极大轰动。古畑任三郎（田村正和 饰）和今泉慎太郎（西村雅彦 饰）都是一郎的粉丝，得知向岛音吉（小林隆 饰）在一郎的酒店担任护卫，二人缠着向岛帮他们索要签名，更令他们惊奇的是向岛竟然是一郎的哥哥。可是脸上永远挂着笑脸的向岛也有他的烦恼，长久以来他一直被有着黑社会背景的男子郡山繁（今井朋彦 饰）勒索，此番更要想法筹备1000万日元。走头无路的向岛打算铤而走险杀掉对方，而与他感情笃深的一郎则要与哥哥共同进行一场完美谋杀案。命案再起，精心策划和布置的现场，古畑刑警最大的挑战……
　　本片为新春完结篇第二部。

　　日本科学技术大学教授上田次郎（阿部宽饰）是一位物理学家。他出版的《滚过来，超常事件》系列丛书描述了他破解诸多超能力骗局的事件。实际上，他还有一个伙伴，落魄的魔术师，已故日本第一魔术师山田刚三的女儿，山田奈绪子（仲间由纪惠饰）。二人一同经历了一个个不可思议事件，并一一揭开 其真相。
　　这一天，一位来自富毛村的男子找到上田次郎，委托他到筐神岛去营救一位叫西田美沙子（堀北真希饰）的女子，而在岛上迎接上田他们的，居然是能移动巨大山石、能穿越生死的超能力者筐神佐和子（片平なぎさ饰）。面对的从未经历的强大对手，二人不仅要探寻事件真相，更要追求自己的心声。

　　南韩北韩即将统一，这也就意味着处于警戒线上的铁路也要随之开通。就在这个节骨眼上，日本方面出面干涉，拿出了一份在1907年同韩国政府签订的条约，指出若是开通铁路便会违反条约上的规定。
　　史学家崔民在（赵宰贤 饰）提出了一个有可能扭转时局的设想，那就是盖在条约上的国印系伪造，也就是说，这份条约没有任何的法律效益。想要证明国印为假，那就必须找出真正的国印，总统（安圣基 饰）全力支持崔民在的论断，并成立了寻找国印委员会。而反对方则将重点放在了维持国家安全和统一的方面，主张和日方维持良好合作关系，为了达到目的，总理（文成根 饰）甚至赋予了情报局秘书官李尚铉（车仁表 饰）抹杀崔民在的权利。