影片设定在《阿凡达》的剧情落幕十余年后，讲述了萨利一家（杰克、奈蒂莉和孩子们）的故事：危机未曾消散，一家人拼尽全力彼此守护、奋力求生，并历经艰险磨难。
　　杰克和奈蒂莉组建了家庭，他们的孩子也逐渐成长，为这个家庭带来了许多欢乐。然而危机未曾消散，萨利一家拼尽全力彼此守护、奋力求生，最终来到潘多拉星球临海的岛礁族寻求庇护。岛礁族首领特诺瓦里与罗娜尔为萨利一家提供了庇护所，这个部族的成员都是天生的潜水好手，也和海洋中的各种生物建立了密切联系。

　　故事设定在“猿流感”病毒蔓延全球的背景下，人类几近毁灭，而进化为高级智慧生物的猿类一跃成为食物链顶端的王者。时移世异，暴虐的猿类首领赛撒（凯文·杜兰 Kevin Durand 饰）在一片废墟中建立起猿族历史上的第一个帝国——“猩球”崛起，这是世界新秩序诞生的黎明时分。神秘的人类女孩诺娃（弗蕾娅·艾伦 Freya Allan 饰）的出现，引起了赛撒的警觉。她似乎掌握着一个巨大的秘密，不仅关乎人类的存亡，甚至可能再度颠覆整个“猩球”。被迫逃亡的诺娃在躲避赛撒军队的过程中，与青年猿类诺亚（欧文·泰格 Owen Teague 饰）的命运交汇，揭开了一段冒险的旅程。

　　Dracula, Werewolf, and the Invisible Man must work together to stop Dr. Frankenstein from creating an unstoppable monster.

　　莉莉丝（凯特·布兰切特 Cate Blanchett 饰）是一个有着神秘过去的赏金猎人，她被迫回到家乡——银河系中最混乱的潘多拉星球，任务是找到阿特拉斯（埃德加·拉米雷兹 Édgar Ramírez 饰）失踪的女儿。莉莉丝与一群不合群的人组成了一个意想不到的联盟，他们是：雇佣兵罗兰（凯文·哈特 Kevin Hart 饰）、爆破专家小蒂娜（阿丽亚娜·格林布拉特 Ariana Greenblatt 饰）、小蒂娜的保护人克里格（弗罗里安·穆特鲁 Florian Munteanu 饰）、古怪的科学家坦尼斯博士（杰米·李·柯蒂斯 Jamie Lee Curtis 饰）和聪明的机器人克拉普特（杰克·布莱克 Jack Black 配音）。这些不可思议的英雄们必须一起与外星生命和危险的强盗战斗，以揭开潘多拉最具爆炸性的秘密。

　　经过长时间的飞行，蕾普莉（西格妮•韦弗 Sigourney Weaver　饰）搭乘的飞船并没有飞回地球！飞船返航途中发生意外，低温休眠舱在母船爆炸前脱离主船，掉进了一个黑暗、寒冷的星球。除了残存的主教外，只有蕾普莉一人生还。
　　这里是地球的一个外星废弃矿井，现在成了一个管制危险犯人的监狱。蕾普莉在医生的救助下恢复了健康。随着蕾普莉的到来，这里的犯人开始一个一个被神秘杀害。当局以为是犯人内部的犯罪，然而蕾普莉隐隐知道没这么简单。
　　当她找出主教的残体连接上电脑查看飞行记录后，证实了她的想法：异形来了。

　　越战后，美国政府进行了一项绝密的科学计划。科学家们将越战中牺牲的士兵的尸体冰冻起来，植入电脑芯片，输入战争程序，讲他们改造成为新一代的战争机器人――“宇宙战士”，这些机器人没有情感和以前的记忆，只有冰冷的杀戮武器。士兵卢克（尚格•云顿 Jean-Claude Van Damme 饰）和班长安德鲁（杜夫•朗格 Dolph Lundgren 饰）就是其中两员，他们被派往参加一场新的战争。战争中，两人的芯片突然出错，令两人都恢复了以前的记忆。
　　卢克记起越战当年正是安德鲁突然性情大变将属下和俘虏都杀光，误闯美军基地的女记者罗伯斯（艾丽•沃克 Ally Walker 饰）意外获悉了美军这一秘密。本来罗伯斯难逃一死，关键时刻卢克救走了她。于是，美军派出所有的宇宙战士开始追杀二人。