自2002年X档案的六年后，前联邦探员丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）调任某教会医院担任医师，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）则过着隐居的生活，继续着对超自然现象的关注。某天，FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内，维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫（Billy Connolly 饰）声称看到了犯罪画面，因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入，穆德和斯科莉却发现案件的黑暗远远超出他们的想象。这对合作多年的搭档面临着巨大的考验……
　　本片为同名美剧的第二部剧场版。

　　1928年美国洛杉矶，在电话局接线台工作的克莉斯汀•柯林斯（Angelina Jolie 安吉莉娜•朱丽 饰）独自抚养儿子沃特（Gattlin Griffith 加特林•格里菲斯 饰），母子的生活简单而幸福。然而她们的生活很快被打乱，某天当克莉斯汀下班后，发现儿子不见踪影。
　　在公众的舆论压力下，腐败的洛杉矶警方于5个月后找回沃特，但克莉斯汀发现这并非自己的亲生儿子。她三番五次要求警方澄清事实，帮其寻找真正的沃特，却一次次受到阻挠和指责，甚至以妨碍警方公务的罪名被送入精神病院。一向以揭露警方暴行为己任的牧师古斯塔夫•布里格拉伯（John Malkovich 约翰•马尔科维奇 饰），为了这个可怜女人的不幸遭遇奔走呼告。
　　另一方面，探员莱斯特（Michael Kelly 饰）在侦办一件偷渡案时，无意中发现了一起重大的连环儿童杀人案。少年沃特的失踪案似乎渐露眉目……

　　单身妈妈珍妮弗·马什（迪安·雷恩 Diane Lane 饰）是供职于FBI网络犯罪科的探员，她日常的工作就是对网络进行监视，查找任何一个盗取信用卡及其他可能造成危害的犯罪分子。在一次围剿信用卡盗贼的行动中，珍妮弗偶然进入一个名为KillwithMe的网站，网站通过视频直播一只小猫受虐死去的全过程。珍妮弗直觉该网站背后必有黑幕，她试图追踪IP和服务器，最终一无所获，似乎她所面对的对手具有颇为复杂的背景。
　　不久，该网站更新内容。画面中一个男子被捆绑起来，网站宣称浏览者越多，那名男子死得越快。珍妮弗等人眼睁睁看着男人死去，她决定不惜一切代价救出幕后黑手，却让自己也卷入这个死亡漩涡之中……

　　外人看来，彼得（连姆·尼森 Liam Neeson 饰）无疑是一个幸福的男人，妻子丽萨（劳拉·琳妮 Laura Linney 饰）温柔漂亮，两人的婚姻稳定而美满。可近日来，彼得发现丽萨的行为举止越来越奇怪，多疑的他本能的想到，丽萨可能已经另结新欢了。面对妻子的出轨，占有欲极强的彼得感到妒火中烧，通过种种线索，一个名叫雷夫（安东尼奥·班德拉斯 Antonio Banderas 饰）的男人浮出了水面。
　　追随着丽萨的脚步，彼得来到了意大利，在这里，他果然见到了雷夫。狡猾的彼得决定先隐藏身份，接近雷夫。可是，随着彼得和雷夫的关系越来越近，彼得发现自己渐渐无法控制自己的言行，他对雷夫的存在深恶痛绝，恨不得杀之而后快。

　　1964年，美国纽约布朗克斯区，圣尼古拉斯天主学校。修女阿洛伊修斯•贝维尔（Meryl Streep 梅丽尔•斯特里普 饰）令行禁止，教条严明，为学生们所畏惧；而新来的布伦丹•弗林的神父（Philip Seymour Hoffman 菲利普•塞默•霍夫曼 饰）则态度和蔼，处事开明，受到学生们的喜爱。
　　这期间，弗林尤其关心学校内有史以来第一位的黑人学生唐纳德•米勒（Joseph Foster 饰）。某天，詹姆斯修女（Amy Adams 饰）将唐纳德的奇怪表现报告给贝维尔修女。贝维尔认定弗林正与男孩发展不正当的关系，她决心不惜一切代价制止。然而事实究竟怎样？

　　某飞机失事后109名乘客仅数名幸存。心理医生克莱尔（安妮•海瑟薇Anne Hathaway 饰）被导师派去对幸存者进行心理治疗，却发现自己渐渐爱上幸存者之一，前证券公司副总裁艾瑞克（帕特里克•威尔森 Patrick Wilson 饰）。与此同时，克莱尔发现诊所外经常有人监视，自己被跟梢，病人神秘失踪，甚至航空公司职员也来威胁她不要多管闲事，这令克莱尔怀疑航空公司为掩盖机械故障的事实，故意用操作失误来掩人耳目避免调查，进而对察觉真相的幸存乘客施以毒手。随着克莱尔与艾瑞克感情的深入，病人竟变得越来越少，克莱尔与姐姐一家也失去联络，甚至就连她的自身安全也面临威胁……

　　地球是人类赖以生存的家园，在供给的同时也在被不断的掠夺着，当地球的忍耐达到极限，人类的下场会是如何呢？
　　近日来，在美国的几大城市里发生了多起离奇的死亡事件，事件现场血腥而诡异。这些人是怎么死的？自杀还是他杀？又因何原因？一切都处在迷雾之中。艾略特（马克·沃尔伯格 Mark Wahlberg 饰）是一名研究自然科学的中学老师，这一连串的事件引起了他的注意，他觉得一切并非巧合。更大规模的人类死亡事件发生了，死亡就像一种病毒一样的在市民之间传染，一时间，城市里人口几乎绝迹。艾略特带着妻子艾尔玛（佐伊·丹斯切尔 Zooey Deschanel 饰）和一群朋友驾着车开始了逃亡之路，他们要躲避的究竟是什么？这连他们自己都不知道。

　　在纽约警察局供职的警探马克思•佩恩（马克·沃尔伯格 Mark Wahlberg 饰）作风硬朗，工作出色。他破解的大案要案不计其数，也亲手将无数罪大恶极的罪犯送入监狱。然而，他冷酷无情的办案方式令他四处树敌，更由此导致妻子、女儿被仇家杀害。为了调查杀害家人的真凶，马克思转入乏人问津的悬案组。在调查某个夜店期间，他邂逅脱衣女郎娜塔莎（Olga Kurylenko 饰），后者在从他家中出来后即被人神秘杀害。次日，马克思与老搭档亚利克斯（Donal Logue 饰）追查谋杀娜塔莎的凶手，但是案件刚刚有所眉目亚利克斯也死于非命，马克思更成为重大嫌疑人。危险正在逼近，马克思最终能否抓到真正的凶手？
　　本片根据同名游戏改编。

　　电视台女主播安吉拉（珍妮弗•卡彭特 Jennifer Carpenter 饰）第一次出镜有些紧张，因为她要参加一个在洛杉矶某消防局与队员共度夜晚的节目。安吉拉性格热情开朗，所以逐渐融入了这个团队，她不但了解了每个人的个性，而且还迅速成为了他们的开心果。然而，突然接到911的报警电话，安吉拉随这群消防队员来到了出事地点。在这座阴森可怖的大楼里，不时传出女人凄厉的尖叫，当地警方已经封锁了大楼，消防队员试图疏散被困人群，却无意中身陷困境。在隔离的区域，一个女人不知感染什么病毒，残忍地伤害了许多人。眼看着消防队员惨遭不幸，自身难保的安吉拉被逼上了绝路……

　　外人看来，彼得（连姆·尼森 Liam Neeson 饰）无疑是一个幸福的男人，妻子丽萨（劳拉·琳妮 Laura Linney 饰）温柔漂亮，两人的婚姻稳定而美满。可近日来，彼得发现丽萨的行为举止越来越奇怪，多疑的他本能的想到，丽萨可能已经另结新欢了。面对妻子的出轨，占有欲极强的彼得感到妒火中烧，通过种种线索，一个名叫雷夫（安东尼奥·班德拉斯 Antonio Banderas 饰）的男人浮出了水面。
　　追随着丽萨的脚步，彼得来到了意大利，在这里，他果然见到了雷夫。狡猾的彼得决定先隐藏身份，接近雷夫。可是，随着彼得和雷夫的关系越来越近，彼得发现自己渐渐无法控制自己的言行，他对雷夫的存在深恶痛绝，恨不得杀之而后快。

　　女记者瑞秋（凯特·贝金赛尔 Kate Beckinsale 饰）从线人处获得了一份情报涉及政府一次相当不光彩的行为。在丈夫雷（大卫·休默 David Schwimmer 饰）支持下刊登了这起新闻报道。政府最终以泄露国家 机密的罪行将瑞秋推上被告席，主审该案件的则是自负的检察官帕顿（马特·狄龙 Matt Dillon 饰）。在法庭上，面对帕顿的层层逼问，瑞秋坦然地叙述了整个事件的前前后后，公众心中的天平也开始往瑞秋方面倾斜，但是艾伦坚持要求瑞秋必须说出资料的提供者是谁，瑞秋逐渐地陷入进退两难的境地。艾伦开始向舆论和瑞秋的家人施加压力，而雷也渐渐地抵抗不住国家给予的压力，建议瑞秋屈服于国家。但瑞秋向雷表达了自己的坚持：真相至上。

　　墨守成规的会计师乔纳森（伊万·麦克格雷格 Ewan McGregor 饰）意外结识风度翩翩的律师怀亚特（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰），怀亚特的热情与幽默让这位极度压抑自我的会计师看到了这个世界金融中心繁华背后的奢靡。怀亚特与乔纳森无所不谈，他告之乔纳森存在一个神秘的性爱俱乐部，那里有无数希望和男人发生一夜情的美女，乔纳森对此表现出憧憬。怀亚特出差前与乔纳森拿错电话，乔纳森意外接到来自性爱俱乐部的电话邀请，考虑再三之后乔纳森最终走入了那片欲望之地，并且在一次约会中偶遇自己在地铁中曾经遭遇的心仪女子“S”。正当乔纳森完全沉浸在幸福之时，意外发生了。自己在旅馆房间被打晕，“S”遭遇绑架，怀亚特神秘失踪，一下子仿佛他这段曾经的经历只发生在自己的妄想之中……